Oddělení hospodářsko-správní zajišťuje základní chod instituce, zajišťuje provozní potřeby (včetně příslušné administrativní agendy), pečuje o majetek svěřený organizaci zřizovatelem, vytváří vhodné pracovní podmínky pro činnost ostatních oddělení, podílí se na prezentační činnosti muzea.
Na financování této organizace se podílí Plzeňský kraj jako zřizovatel